Pentadbiran Majlis diketuai oleh Yang Dipertua dan dibantu oleh Setiausahanya. Keanggotaan Ahli Mesyuarat Majlis adalah seramai 24 orang yang terdiri daripada 12 orang dari UMNO, 9 orang dari MCA, 2 orang dari MIC dan 1 dari Gerakan.  Senarai Ahli-ahli Majlis 2009 – 2010 Majlis Daerah Pontian Duduk dari kiri : En. Tan Chin Hok, Tn. Hj. Hanaffi Bin Senusi, En. Nasir Bin Sama’on, En. Mohd. Farid Bin Hassan (Setiausaha), Tn. Hj. Mohamad Bin Hj. Karim (Yang Dipertua), Tn. Hj. Malik @ Abd. Malik Bin Ibrahim (Ketua Whip), En. Goh Eng Siang, En. Baharuddin Bin Bahari, Cik Tan Sew Gwat, En. Suhaimi Bin Salleh. Berdiri dari kiri (Barisan 1): En. Lua Chuan Huat, En. Cheng Lip Ka, En. Tan Soon Lam, Pn. Norzita Binti Kahar, Pn. Hjh. Aminah Binti Abdullah, Pn. Hjh. Azizah Binti Osman, En. Tan Eng Meng Berdiri dari kiri (Barisan 2): En. Ng. Koh Lon, Tn. Hj. Bedu Kerik Bin Tombong, Tn. Hj. Arshad Bin Daing Matirok, Tn. Hj. Karmaine Bin Sardini, En. Tan Say Boon |
Selain daripada itu, pentadbiran majlis juga telah dibahagikan kepada 6 jabatan yang diketuai oleh seorang pegawai iaitu :- a) Bahagian Khidmat Pengurusan | | | i) Bahagian Pentadbiran diketuai oleh Puan Junaidah Binti Kamal |  | | ii) Bahagian Penguatkuasaan | | b) Jabatan Perbendaharaan diketua oleh Cik Halijah Binti Umor | 
| c) Jabatan Penilaian & Pengurusan Harta diketuai oleh En. Muhammad Faisal Bin Othman |
| d) Jabatan Perancang, Pembangunan dan Landskap diketuai oleh Cik Junaidah Binti Ahmad |  | e) Jabatan Kejuruteraan & Pembangunan diketuai oleh En. Ahmad Kamal Bin Alias | 
| f) Jabatan Perkhidmatan Perbandaran dan Pelesenan diketuai oleh En. Ibrahim bin Omar |  | i) Bahagian Kebersihan diketuai oleh Tn. Hj. Mohhid bin Wagimin |  | ii) Bahagian Pelesenan diketuai oleh En. Saad bin Hashim | | | g) Unit Undang-undang diketuai oleh Cik Nazlin Bin Ahmad | | | i) Unit OSC diketuai oleh Cik Zahrah Binti Mohktar | | | j) Unit Pelancongan diketuai oleh Norfaizah Binti Pa'at | | Kakitangan Majlis Daerah Pontian terdiri daripada 147 orang merangkumi kakitangan Pentadbiran dan Operasi. |